タイトルの通り、Office for Mac(Excel)で「ツール」メニューから「ショートカットキーのユーザー設定」が表示されません。 通常では以下図の「アドイン」の下にショートカットキーのユーザー設定が表示されて選択できるはずなのですが。 インストールしたは2015年12月中旬で最新バージョンをインストールして、最新バージョンに更新されております。

https://answers.microsoft.com/ja-jp/msoffice/forum/msoffice_excel-mso_mac-mso_mac2016/mac%E3%81%A7%E3%82%B7%E3%83%A7%E3%83%BC%E3%83%88/c0522b8f-ecbe-4ea2-a767-620bf4a1bf7d